More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3333 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 337 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  46.67 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  49.18 
 
 		 937 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.62 
 
 		 881 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  22.07 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 894 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.16 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  46.97 
 
 		 903 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  26.22 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2317  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000209491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 214 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 856 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  25.1 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0302  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  23.03 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  38.81 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 880 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  23.56 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 907 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.67 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 845 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.62 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 550 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 574 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.43 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.06 
 
 		 505 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 194 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  23.26 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 252 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 211 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 907 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 907 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 218 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 956 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 567 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 230 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  37.65 
 
 		 865 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 204 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 919 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 208 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  46.03 
 
 		 919 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  47.27 
 
 		 919 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2565  response regulator protein  49.09 
 
 		 213 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140338  decreased coverage  0.00000000000000164026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 211 aa  53.1  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 385 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 151 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 229 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  47.92 
 
 		 222 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 74 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 959 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 228 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0205  LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 205 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4027  LuxR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 275 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 501 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 213 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 229 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  41 
 
 		 954 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  51.72 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  49.02 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>