148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1112 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  943    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  34.35 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  29.02 
 
 		 1310 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  27.04 
 
 		 1306 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  32.92 
 
 		 564 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.73 
 
 		 1035 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  25.76 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  41.38 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  28.21 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1367 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1879 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.48 
 
 		 692 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.11 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  41.51 
 
 		 1170 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  51.56 
 
 		 1672 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  59.02 
 
 		 3911 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  43.68 
 
 		 1222 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  46.48 
 
 		 1222 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  29.92 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  43.04 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  41.25 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  41.25 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.34 
 
 		 1673 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  32.05 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 1272 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  49.23 
 
 		 1394 aa  57  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.75 
 
 		 553 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  41.1 
 
 		 624 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.1 
 
 		 818 aa  57  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.77 
 
 		 837 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  37.11 
 
 		 1123 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.2 
 
 		 1679 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.65 
 
 		 1919 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.82 
 
 		 4761 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  32.28 
 
 		 784 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.14 
 
 		 941 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.52 
 
 		 1967 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  34.13 
 
 		 544 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  37.5 
 
 		 778 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  45.76 
 
 		 618 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  39.33 
 
 		 870 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.7 
 
 		 6678 aa  53.5  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40 
 
 		 921 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  25.56 
 
 		 247 aa  53.5  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  44.59 
 
 		 1232 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  40.86 
 
 		 1626 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  28.95 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  25.35 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 2082 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.03 
 
 		 821 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  24.81 
 
 		 250 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.24 
 
 		 1424 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  27.12 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  42.11 
 
 		 714 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  46.77 
 
 		 1544 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  41.46 
 
 		 1129 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.24 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.63 
 
 		 1735 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  36.84 
 
 		 14609 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30.71 
 
 		 743 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.94 
 
 		 878 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  37.35 
 
 		 566 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.02 
 
 		 1848 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  31.25 
 
 		 1187 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1265 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2229  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  35.06 
 
 		 273 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0720047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.51 
 
 		 561 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  40.26 
 
 		 717 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  32.58 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  32.29 
 
 		 1207 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1931 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  35.53 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  40.79 
 
 		 133 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  24.68 
 
 		 258 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  35.53 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.75 
 
 		 787 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  32.89 
 
 		 846 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  36.71 
 
 		 577 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  32.61 
 
 		 298 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.75 
 
 		 575 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.11 
 
 		 726 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 		 11716 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  31.93 
 
 		 891 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.09 
 
 		 523 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.86 
 
 		 1298 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 4357 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  33.75 
 
 		 602 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.93 
 
 		 817 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.25 
 
 		 535 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  24.91 
 
 		 247 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  34.09 
 
 		 3907 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  41.94 
 
 		 311 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  25.19 
 
 		 250 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  24.09 
 
 		 258 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 692 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.32 
 
 		 864 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.99 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  44.07 
 
 		 1241 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>