97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2789 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  259  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  93.39 
 
 		 447 aa  204  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  47.93 
 
 		 1207 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  44.88 
 
 		 1187 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  51.35 
 
 		 326 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.42 
 
 		 787 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  43.75 
 
 		 941 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  43.9 
 
 		 535 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  41.46 
 
 		 817 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  52.34 
 
 		 454 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  42.86 
 
 		 544 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  44.07 
 
 		 792 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.86 
 
 		 1147 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.33 
 
 		 837 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  43.16 
 
 		 602 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.36 
 
 		 553 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  42.62 
 
 		 618 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  41.07 
 
 		 778 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.8 
 
 		 556 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.25 
 
 		 810 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  41.46 
 
 		 784 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  41.51 
 
 		 776 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  43.96 
 
 		 389 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.78 
 
 		 555 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  37.74 
 
 		 376 aa  65.5  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  39.22 
 
 		 477 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  35.71 
 
 		 593 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  39.13 
 
 		 546 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  40.38 
 
 		 900 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.15 
 
 		 561 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  35.24 
 
 		 553 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.62 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.56 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  38.6 
 
 		 551 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  35.09 
 
 		 569 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  38.38 
 
 		 835 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  38.46 
 
 		 681 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.84 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  34.38 
 
 		 566 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  37.93 
 
 		 743 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  34.69 
 
 		 558 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  38.55 
 
 		 577 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  35.4 
 
 		 579 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 396 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.62 
 
 		 821 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.61 
 
 		 567 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2082 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.19 
 
 		 563 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.58 
 
 		 1848 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  37.93 
 
 		 558 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 547 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.67 
 
 		 555 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  43.02 
 
 		 363 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 449 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.96 
 
 		 1679 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  43.02 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  42.17 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  38.61 
 
 		 418 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  41.86 
 
 		 714 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  35.92 
 
 		 643 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  40.79 
 
 		 471 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  37.04 
 
 		 554 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.73 
 
 		 818 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.29 
 
 		 1919 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  31.4 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  39.13 
 
 		 560 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  33.03 
 
 		 1312 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  32.99 
 
 		 14609 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.08 
 
 		 469 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.38 
 
 		 1126 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  37.5 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  29.06 
 
 		 533 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  38.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.09 
 
 		 737 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  34.83 
 
 		 1222 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.34 
 
 		 706 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  40.2 
 
 		 638 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.79 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  33.33 
 
 		 643 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  39.51 
 
 		 717 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28588  predicted protein  38.89 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.73 
 
 		 692 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  33.01 
 
 		 443 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  31.11 
 
 		 911 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02073  BTB domain and ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04760)  30.43 
 
 		 1680 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.768919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  31.82 
 
 		 807 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  30.56 
 
 		 547 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  41.57 
 
 		 727 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  32.18 
 
 		 461 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  32.43 
 
 		 212 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 403 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  34.78 
 
 		 558 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  30.95 
 
 		 624 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40439  predicted protein  34.74 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0503657 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  32.61 
 
 		 390 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  32.11 
 
 		 450 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  32.05 
 
 		 461 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>