More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2824 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1018 aa  2102    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.83 
 
 
1054 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.68 
 
 
798 aa  741    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.81 
 
 
798 aa  728    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.06 
 
 
1021 aa  1118    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
661 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.69 
 
 
885 aa  361  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
925 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
1132 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1260 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
1102 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
1079 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 
824 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
736 aa  317  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
1260 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
1106 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
769 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
773 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 
845 aa  313  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
853 aa  313  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 
773 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
743 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
962 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
777 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
859 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  44.73 
 
 
733 aa  306  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
656 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
983 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
741 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  32.09 
 
 
1561 aa  304  6.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
845 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 
1180 aa  303  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 
664 aa  303  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 
946 aa  303  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
740 aa  302  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 
650 aa  301  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
926 aa  298  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
657 aa  296  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
953 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
823 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
819 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 
663 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 
1023 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
758 aa  295  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
853 aa  295  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1113 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  40.76 
 
 
571 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  39.31 
 
 
654 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
766 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
557 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  42.24 
 
 
726 aa  291  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
643 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 
822 aa  290  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
668 aa  290  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  39.18 
 
 
1065 aa  290  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
849 aa  290  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
622 aa  289  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
1065 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
828 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  40.21 
 
 
654 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1176 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
1105 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  38.83 
 
 
949 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
774 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
949 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1051 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 
1023 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
625 aa  284  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
727 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
642 aa  284  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
642 aa  284  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  39.14 
 
 
529 aa  283  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
637 aa  283  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
1076 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 
817 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
727 aa  282  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1124 aa  281  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  38.35 
 
 
525 aa  281  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1053 aa  281  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  41.48 
 
 
812 aa  281  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
796 aa  280  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
796 aa  280  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  39.95 
 
 
1015 aa  279  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
1108 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
655 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  37.25 
 
 
527 aa  279  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
905 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1036 aa  277  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
1047 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  40.2 
 
 
844 aa  277  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 
1134 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
1631 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
994 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
943 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  40.41 
 
 
749 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
751 aa  275  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  39.01 
 
 
573 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
641 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
810 aa  274  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 
955 aa  273  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>