More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1065 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 698 aa  1409    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  41.04 
 
 		 721 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 719 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  35.01 
 
 		 715 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.96 
 
 		 747 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  34.28 
 
 		 709 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  33.71 
 
 		 709 aa  331  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  30.7 
 
 		 724 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 756 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  29.88 
 
 		 798 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  31.34 
 
 		 690 aa  139  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  29.6 
 
 		 750 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  33.16 
 
 		 750 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 750 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.47 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  30.41 
 
 		 748 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.01 
 
 		 669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  43.42 
 
 		 643 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  32.55 
 
 		 661 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  31.94 
 
 		 729 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  23.74 
 
 		 797 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 660 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  28.86 
 
 		 720 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  28.94 
 
 		 730 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  41.94 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  41.94 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 		 686 aa  118  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 645 aa  118  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 645 aa  118  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 645 aa  118  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 197 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 648 aa  114  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  28.46 
 
 		 664 aa  114  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  40.76 
 
 		 645 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  27.98 
 
 		 730 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  37.35 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.49 
 
 		 650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  30.58 
 
 		 644 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  38.67 
 
 		 686 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  31.65 
 
 		 657 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  27.48 
 
 		 681 aa  113  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  40.94 
 
 		 677 aa  112  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  38.36 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 763 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  32.37 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.33 
 
 		 641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 643 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  32.37 
 
 		 642 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  38.73 
 
 		 677 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  29.34 
 
 		 735 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  30.39 
 
 		 757 aa  111  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 782 aa  110  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  27.75 
 
 		 730 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  36.14 
 
 		 642 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  40.26 
 
 		 688 aa  110  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  38.41 
 
 		 643 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  30.03 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  32.2 
 
 		 643 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  42.86 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  31.38 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  30.03 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  30.25 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  30.25 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  29.9 
 
 		 760 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  29.01 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  30.25 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  40.25 
 
 		 182 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  42.86 
 
 		 700 aa  108  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  41.18 
 
 		 717 aa  108  5e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  31.21 
 
 		 593 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2210  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 725 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847947  normal  0.0413346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 		 641 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 642 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  31.46 
 
 		 643 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 776 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  31.21 
 
 		 593 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  35.4 
 
 		 735 aa  106  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 663 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 		 649 aa  106  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  39.88 
 
 		 653 aa  106  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  39.74 
 
 		 661 aa  106  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  29.24 
 
 		 637 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.37 
 
 		 644 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>