204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3430 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  62.35 
 
 		 530 aa  645    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 512 aa  1034    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  36.58 
 
 		 578 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 574 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1450 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.8 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1451 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 540 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1454 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  37.24 
 
 		 360 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 3145 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 688 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 601 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.66 
 
 		 1677 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 602 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 747 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 		 1005 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 520 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 1212 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 		 604 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.92 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 556 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1827 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 615 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 607 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 955 aa  156  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.86 
 
 		 1764 aa  156  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  34.78 
 
 		 385 aa  156  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 767 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  32.69 
 
 		 630 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 636 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 935 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.57 
 
 		 1034 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 523 aa  154  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.91 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 780 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.95 
 
 		 703 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 607 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.39 
 
 		 714 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 592 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.38 
 
 		 603 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.96 
 
 		 653 aa  149  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 653 aa  149  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 637 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1038 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30.22 
 
 		 1077 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 546 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28.9 
 
 		 648 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 747 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 649 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 649 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 		 760 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33.23 
 
 		 872 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.22 
 
 		 473 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 714 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 681 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  31.51 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  33.95 
 
 		 705 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 740 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  31.8 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 646 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.11 
 
 		 620 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 637 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 		 662 aa  136  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  31.99 
 
 		 525 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 588 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 639 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  32.86 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.28 
 
 		 689 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  32.07 
 
 		 360 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 612 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 536 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  29.87 
 
 		 546 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 620 aa  133  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 923 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 611 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 545 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 		 541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  33.8 
 
 		 600 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 496 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.98 
 
 		 626 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.49 
 
 		 646 aa  130  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  28.65 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>