155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0726 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  38.42 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  44.81 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  36.81 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  39.05 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 190 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.96 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  32.96 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  31.41 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.52 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  20.62 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  25.73 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  24.54 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  28 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  25.15 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 400 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>