100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0440 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  33.06 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 156 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  25.37 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  32.69 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  28.71 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  21.55 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  20.77 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  25 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  29.33 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 146 aa  42  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 151 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 172 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 151 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 165 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 155 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 136 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  22.32 
 
 		 212 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  25.58 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  29.23 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  31.4 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  23.36 
 
 		 157 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 166 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 213 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 170 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>