101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1242 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1096    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  60.79 
 
 		 777 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  61.22 
 
 		 916 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  57.42 
 
 		 534 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  39.52 
 
 		 1951 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  48.75 
 
 		 2042 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  44.57 
 
 		 2528 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  45.39 
 
 		 1804 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1902 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  38.95 
 
 		 2192 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  39.02 
 
 		 899 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  38.26 
 
 		 898 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  34.02 
 
 		 913 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  37.31 
 
 		 1585 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  35.28 
 
 		 1096 aa  134  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  36.4 
 
 		 1588 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  40.94 
 
 		 827 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  55.46 
 
 		 1141 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 888 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  34.86 
 
 		 937 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  36.18 
 
 		 2178 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  38.35 
 
 		 1439 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  32.24 
 
 		 906 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  32.64 
 
 		 499 aa  97.4  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  30.32 
 
 		 3586 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  40.56 
 
 		 577 aa  90.1  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  44.67 
 
 		 1496 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  35.74 
 
 		 675 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  36.75 
 
 		 1537 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  33.01 
 
 		 3925 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  43.64 
 
 		 2002 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  42.11 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.82 
 
 		 2117 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  43.43 
 
 		 1538 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.44 
 
 		 2350 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  30.1 
 
 		 711 aa  67  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  29.55 
 
 		 6109 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.8 
 
 		 3824 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.07 
 
 		 3739 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.8 
 
 		 3824 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.53 
 
 		 3824 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.49 
 
 		 3721 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  29.51 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  28.95 
 
 		 3734 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  31.21 
 
 		 1461 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  30.37 
 
 		 1219 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.77 
 
 		 1332 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.61 
 
 		 5561 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  28.99 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.61 
 
 		 5561 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.98 
 
 		 5561 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.84 
 
 		 4874 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.87 
 
 		 3736 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  31.37 
 
 		 793 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.98 
 
 		 5559 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  35.75 
 
 		 1047 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.98 
 
 		 5559 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  32.34 
 
 		 696 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  29.61 
 
 		 7149 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  33.05 
 
 		 2030 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  23.12 
 
 		 1695 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 6683 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 6662 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  36.71 
 
 		 614 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 6779 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  29.24 
 
 		 1621 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.47 
 
 		 2552 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.61 
 
 		 2927 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.86 
 
 		 587 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1457 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  31.07 
 
 		 694 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  31.99 
 
 		 4689 aa  50.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.83 
 
 		 5216 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  25.79 
 
 		 1570 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  32.24 
 
 		 3325 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  28.7 
 
 		 5444 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  28.17 
 
 		 739 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.89 
 
 		 4106 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.3 
 
 		 1570 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.24 
 
 		 5442 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.73 
 
 		 4791 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  35.42 
 
 		 606 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.24 
 
 		 5839 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1657 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  38.83 
 
 		 1613 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  23.97 
 
 		 892 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.42 
 
 		 3562 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.3 
 
 		 1152 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2793  hypothetical protein  27.66 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.430464  hitchhiker  0.000384805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.3 
 
 		 3552 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 		 1505 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  27.64 
 
 		 2768 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.39 
 
 		 1919 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  25.47 
 
 		 820 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.42 
 
 		 5743 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0517  Ig domain protein group 1 domain protein  35.38 
 
 		 1028 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  25 
 
 		 5171 aa  44.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  27.4 
 
 		 1795 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  30.32 
 
 		 771 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.14 
 
 		 14944 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>