More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0225 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 745 aa  1436    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  50.29 
 
 		 713 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  48.85 
 
 		 699 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  49.13 
 
 		 699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  44.44 
 
 		 730 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  49.54 
 
 		 709 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  49.92 
 
 		 701 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  46.8 
 
 		 714 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  47.08 
 
 		 682 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  43.43 
 
 		 699 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  44.44 
 
 		 712 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  43.3 
 
 		 753 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.43 
 
 		 702 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  44.32 
 
 		 706 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  43.39 
 
 		 737 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  43.99 
 
 		 780 aa  438  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  45.88 
 
 		 778 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  46.36 
 
 		 714 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.58 
 
 		 812 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  46.16 
 
 		 713 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  43.53 
 
 		 674 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  43.53 
 
 		 674 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  43.53 
 
 		 674 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  47.65 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  43.79 
 
 		 775 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  41.59 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  44.87 
 
 		 750 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  44.09 
 
 		 697 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  42.74 
 
 		 733 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  45.9 
 
 		 679 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  43.47 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  43.02 
 
 		 700 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  42.24 
 
 		 707 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  42.68 
 
 		 764 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  43.1 
 
 		 727 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  46.18 
 
 		 762 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  43.54 
 
 		 708 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  43.15 
 
 		 704 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  44.94 
 
 		 686 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  40.7 
 
 		 711 aa  325  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.45 
 
 		 713 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.83 
 
 		 743 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  33.01 
 
 		 743 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  33.01 
 
 		 743 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.36 
 
 		 743 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.36 
 
 		 743 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  43.45 
 
 		 673 aa  303  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.22 
 
 		 743 aa  303  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.08 
 
 		 743 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  31.82 
 
 		 743 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.46 
 
 		 743 aa  300  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  32.73 
 
 		 743 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.26 
 
 		 712 aa  261  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  31.29 
 
 		 723 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  50.15 
 
 		 339 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  30.17 
 
 		 740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  44.94 
 
 		 358 aa  225  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  35.55 
 
 		 747 aa  224  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  56.33 
 
 		 777 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.75 
 
 		 726 aa  204  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  30.31 
 
 		 882 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.05 
 
 		 717 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  31.1 
 
 		 836 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.79 
 
 		 736 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.32 
 
 		 719 aa  177  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.36 
 
 		 718 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.41 
 
 		 726 aa  164  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  28.7 
 
 		 981 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.35 
 
 		 758 aa  149  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  35.65 
 
 		 974 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.89 
 
 		 974 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.66 
 
 		 729 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  27.53 
 
 		 732 aa  145  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.52 
 
 		 724 aa  144  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  42.25 
 
 		 1146 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  28.62 
 
 		 920 aa  140  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.7 
 
 		 714 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.27 
 
 		 1077 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  27.36 
 
 		 742 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  28.81 
 
 		 842 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  41.4 
 
 		 945 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  41.4 
 
 		 945 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  29.18 
 
 		 832 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  29.49 
 
 		 737 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  27.46 
 
 		 934 aa  135  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.55 
 
 		 734 aa  135  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  40.08 
 
 		 1000 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.53 
 
 		 741 aa  134  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  26.73 
 
 		 781 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  26.21 
 
 		 979 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  30.71 
 
 		 732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  42.11 
 
 		 998 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  42.11 
 
 		 998 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  42.11 
 
 		 998 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  28.1 
 
 		 735 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  25.81 
 
 		 737 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  39.66 
 
 		 1001 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  29.36 
 
 		 854 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  30.8 
 
 		 717 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  26.09 
 
 		 983 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>