241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4330 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 516 aa  1018    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  48.1 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  45.45 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  42.63 
 
 		 465 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 453 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 412 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  46.15 
 
 		 630 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  38.11 
 
 		 836 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  45.49 
 
 		 854 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.82 
 
 		 991 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  38.83 
 
 		 905 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  35.38 
 
 		 829 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 1007 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  43.5 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  37.13 
 
 		 854 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  38.28 
 
 		 769 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  34.62 
 
 		 683 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  38.14 
 
 		 807 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 1132 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  36.69 
 
 		 817 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  35.63 
 
 		 805 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  35.24 
 
 		 841 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  35.04 
 
 		 965 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  35.71 
 
 		 763 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  39.12 
 
 		 797 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  33.82 
 
 		 669 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.6 
 
 		 801 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  46.67 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  33.33 
 
 		 697 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  35.79 
 
 		 839 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  34.2 
 
 		 1560 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  38.51 
 
 		 818 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1282 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  38.54 
 
 		 843 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  31.32 
 
 		 821 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.47 
 
 		 670 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  32.37 
 
 		 735 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  36.17 
 
 		 637 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  34.78 
 
 		 795 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  36.5 
 
 		 1281 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 1077 aa  144  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  36.97 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  35.07 
 
 		 950 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  33.46 
 
 		 973 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  39.04 
 
 		 1023 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.29 
 
 		 687 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.36 
 
 		 957 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.25 
 
 		 996 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  36.99 
 
 		 1026 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  32.84 
 
 		 950 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 1119 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  34.07 
 
 		 1092 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  30.98 
 
 		 974 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  34.01 
 
 		 458 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.89 
 
 		 1049 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  38.1 
 
 		 769 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  32.79 
 
 		 1051 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 1182 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  33.2 
 
 		 1004 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 1034 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  33.86 
 
 		 1047 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  33.11 
 
 		 1060 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 1268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.22 
 
 		 817 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  32.57 
 
 		 1310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  33.21 
 
 		 1402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  31.47 
 
 		 1022 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 1435 aa  117  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 1000 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  33.94 
 
 		 1152 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  36.84 
 
 		 769 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  30.29 
 
 		 1031 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  30.49 
 
 		 1148 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  33.6 
 
 		 832 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.48 
 
 		 879 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.96 
 
 		 764 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  32.99 
 
 		 814 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  30.82 
 
 		 1164 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 851 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 851 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 851 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 860 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.87 
 
 		 799 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.21 
 
 		 794 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  31.54 
 
 		 863 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  35.24 
 
 		 876 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  32.78 
 
 		 733 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  33.19 
 
 		 832 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  31.3 
 
 		 1076 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  27.6 
 
 		 839 aa  94.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  32.87 
 
 		 484 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  31.53 
 
 		 575 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  27.83 
 
 		 895 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  29.07 
 
 		 798 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 803 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>