More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2408 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.87 
 
 		 463 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 463 aa  929    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.87 
 
 		 463 aa  868    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.22 
 
 		 463 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  71.05 
 
 		 464 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  65.94 
 
 		 465 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  65.8 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.23 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 463 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  39.16 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  41.94 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  35.6 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  36.53 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 466 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 533 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 472 aa  196  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  32.83 
 
 		 467 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 467 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  31.57 
 
 		 486 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 486 aa  187  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  36.62 
 
 		 499 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  40.93 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 469 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  31.6 
 
 		 468 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  31.02 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  39.49 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  32.77 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  31.79 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  39.43 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  31.37 
 
 		 468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0275  sensor histidine kinase  36.94 
 
 		 571 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  34.25 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 464 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  33.76 
 
 		 445 aa  159  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  36.7 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  33.66 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.29 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 504 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>