More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1371 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.53 
 
 		 469 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  72.32 
 
 		 469 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  100 
 
 		 468 aa  934    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.31 
 
 		 465 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  56.44 
 
 		 467 aa  494  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  56.65 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.51 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.89 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  52.61 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  46.71 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  46.07 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  46.78 
 
 		 481 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 486 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  44.17 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 502 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 466 aa  326  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 533 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 481 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  33.62 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  29.23 
 
 		 411 aa  183  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  30.43 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 418 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 468 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  29.61 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1600  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.298704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  30.13 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  28.54 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 445 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  28.16 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 472 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 472 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  29.41 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  30.34 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.83 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  32.52 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  34.87 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  29.73 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.02 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>