More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9847 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  100 
 
 		 457 aa  922    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  35.19 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 490 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 488 aa  204  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 480 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 486 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  32.14 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 477 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 467 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 492 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  30.67 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 472 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  30.45 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  30.15 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  28.26 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 469 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  37.25 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  36.6 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  30.43 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 465 aa  177  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  36.27 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 463 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  36.77 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  34.58 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.83 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 456 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  36.27 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  36.89 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 472 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  33.56 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  29.28 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 465 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  34.05 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  30.98 
 
 		 499 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 386 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 499 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.09 
 
 		 461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 505 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 505 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  31.14 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.57 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>