More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0091 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  79.61 
 
 		 415 aa  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 413 aa  845    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  74.94 
 
 		 418 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.7 
 
 		 418 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  74.7 
 
 		 418 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.7 
 
 		 418 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.7 
 
 		 418 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.45 
 
 		 418 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.97 
 
 		 411 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.97 
 
 		 411 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  73.72 
 
 		 411 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.3 
 
 		 419 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.83 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.02 
 
 		 407 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  69.1 
 
 		 445 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  71.12 
 
 		 419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 502 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  38.16 
 
 		 469 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 469 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  34.97 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  35.59 
 
 		 468 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  35.22 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  35.54 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 480 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  35 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  33.55 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  32.63 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 489 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  36.72 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  36.1 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  33 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 469 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 465 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 468 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 464 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  31.32 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 452 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 463 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 463 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  32.97 
 
 		 463 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  34.8 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  31.89 
 
 		 465 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 515 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 		 466 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 464 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 499 aa  136  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  30.12 
 
 		 499 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  30.07 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 461 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  29.67 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>