More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4109 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  914    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.56 
 
 		 419 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.4 
 
 		 445 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.66 
 
 		 407 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  71.77 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.77 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.77 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.77 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  71.05 
 
 		 418 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.81 
 
 		 418 aa  624  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  70.56 
 
 		 411 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  70.56 
 
 		 411 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  70.32 
 
 		 411 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  69.86 
 
 		 419 aa  595  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  69.1 
 
 		 413 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  67.23 
 
 		 415 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 462 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  38 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  36.33 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 486 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  36.33 
 
 		 467 aa  176  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 460 aa  176  8e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  29.59 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 502 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  36.77 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  38.76 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  33.99 
 
 		 481 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 487 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  35.36 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  27.59 
 
 		 476 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  27.16 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 482 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  33.44 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 463 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  33.1 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  30.34 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  34.83 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  35.83 
 
 		 465 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  25.32 
 
 		 468 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  36.08 
 
 		 465 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  36.18 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 499 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  32.61 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 386 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 472 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 472 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  28.47 
 
 		 481 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 536 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.57 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>