More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5680 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.1 
 
 
472 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  100 
 
 
443 aa  885    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.1 
 
 
472 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.86 
 
 
463 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.86 
 
 
463 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.41 
 
 
463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.41 
 
 
463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  55.41 
 
 
463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0275  sensor histidine kinase  76.77 
 
 
571 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
463 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
463 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
463 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
461 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  35.21 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
464 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  34.91 
 
 
465 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
456 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
488 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
467 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
472 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
492 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  33.07 
 
 
445 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
468 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  36.09 
 
 
483 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
515 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
461 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
477 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
477 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
488 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
486 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
465 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
466 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
502 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
533 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
469 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
486 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  34.71 
 
 
469 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
469 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  29.57 
 
 
468 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
490 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
413 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  30.13 
 
 
481 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
489 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
467 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  31.26 
 
 
466 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
487 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  35.74 
 
 
418 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  34.8 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
419 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
462 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  34.8 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
411 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
411 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
486 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  30.16 
 
 
486 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  32.07 
 
 
467 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
464 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  32.66 
 
 
476 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
464 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
468 aa  146  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  31.82 
 
 
467 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  31.99 
 
 
499 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  31.32 
 
 
476 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
499 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
482 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  34.15 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
445 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
469 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
465 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
407 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  36.92 
 
 
419 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  32.61 
 
 
445 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
476 aa  136  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
472 aa  136  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.46 
 
 
415 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  30.21 
 
 
481 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  30.86 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  30.94 
 
 
476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
451 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  31.67 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
481 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
449 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
458 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
438 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
465 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  31.2 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
473 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
454 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
469 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
461 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.9 
 
 
490 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>