More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0275 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0275  sensor histidine kinase  100 
 
 
571 aa  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.75 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.75 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  76.77 
 
 
443 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  60.38 
 
 
463 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.38 
 
 
463 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.38 
 
 
463 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.75 
 
 
463 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.75 
 
 
463 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
463 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  33.54 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  33.12 
 
 
465 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
456 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
466 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
515 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
486 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
489 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
467 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
468 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
486 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
490 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
472 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
461 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
488 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
533 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
502 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
486 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
492 aa  90.5  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
469 aa  90.5  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  30.1 
 
 
486 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  34.63 
 
 
483 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
469 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
477 aa  88.2  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
465 aa  87.8  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
482 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
462 aa  87  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  28.92 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  28.48 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
468 aa  84  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
480 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
476 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  35.29 
 
 
469 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  26.38 
 
 
481 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  28.38 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  28.62 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
451 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  36.26 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  36.26 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  35.92 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  26.53 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
468 aa  73.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  31.94 
 
 
460 aa  70.9  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  35.76 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
445 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
413 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  34.25 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  33.56 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  33.61 
 
 
481 aa  67  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  24.92 
 
 
468 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  33.57 
 
 
457 aa  67  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  34.43 
 
 
499 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  29.94 
 
 
471 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  31.39 
 
 
471 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  31.39 
 
 
472 aa  63.9  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  34.31 
 
 
469 aa  63.5  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
449 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  32.48 
 
 
583 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  33.78 
 
 
508 aa  62.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.78 
 
 
415 aa  60.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.72 
 
 
463 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
448 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
464 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  33.08 
 
 
466 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  34.29 
 
 
508 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>