More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4259 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 508 aa  999    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 		 534 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  45.96 
 
 		 475 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  46.75 
 
 		 515 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 498 aa  326  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  43.78 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 513 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  41.63 
 
 		 508 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  42.89 
 
 		 517 aa  283  6.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  34.59 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 537 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  35.7 
 
 		 555 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  33.96 
 
 		 507 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  36.24 
 
 		 469 aa  263  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 501 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2684  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 513 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7131  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.84 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 544 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2868  histidine kinase  33.13 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.63 
 
 		 503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 438 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 513 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 469 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.77 
 
 		 490 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  34.44 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  35.62 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.33 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 601 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  28.97 
 
 		 497 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 504 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  36.39 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  28.75 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.4 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  33.77 
 
 		 481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  31.6 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 532 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.96 
 
 		 518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 487 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  34.82 
 
 		 506 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 459 aa  136  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  27.85 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 478 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 532 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  33.33 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.36 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.14 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.14 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.62 
 
 		 593 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 474 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 639 aa  134  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  35.05 
 
 		 566 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  34.34 
 
 		 483 aa  133  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 479 aa  133  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  32.67 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  27.56 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.54 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  36.09 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>