More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1037 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  79.46 
 
 		 252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  54.04 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  51.85 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  49.37 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  50.21 
 
 		 240 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  46.91 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  46.46 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 		 204 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.51 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.1 
 
 		 373 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  31.06 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1548  polysaccharide deacetylase  42.42 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  35.06 
 
 		 373 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 368 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.11 
 
 		 417 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.19 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  43.59 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 387 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  26.11 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  41.4 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 302 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 235 aa  98.6  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 372 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 		 404 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  38.04 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 352 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 222 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 239 aa  96.3  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  33.77 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.96 
 
 		 468 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.84 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.11 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.49 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 522 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.19 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.12 
 
 		 241 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.63 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  41.77 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  29.9 
 
 		 481 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  37.34 
 
 		 522 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  28.24 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>