More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3936 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 762 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 		 752 aa  707    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.67 
 
 		 755 aa  1126    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 757 aa  1563    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 743 aa  585  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 758 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  32.31 
 
 		 762 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 775 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 779 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 751 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 758 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 775 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  31.58 
 
 		 776 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 760 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 760 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 765 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 769 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 749 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 799 aa  386  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 746 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 751 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 769 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 760 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 751 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 1013 aa  360  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 791 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 746 aa  350  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  30.47 
 
 		 755 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 748 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 762 aa  343  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 748 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 756 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 774 aa  337  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1002 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 745 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1002 aa  317  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1002 aa  316  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  33.46 
 
 		 755 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  34.45 
 
 		 798 aa  306  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  29.84 
 
 		 745 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.1 
 
 		 745 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  28.72 
 
 		 759 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 856 aa  300  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 		 770 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  32.97 
 
 		 772 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  29.56 
 
 		 855 aa  287  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  28.95 
 
 		 728 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  31.95 
 
 		 842 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 759 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 771 aa  282  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  28.51 
 
 		 728 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  25.75 
 
 		 1003 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  26.45 
 
 		 993 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  31.35 
 
 		 783 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  31.72 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  31.75 
 
 		 738 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.52 
 
 		 849 aa  270  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 722 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 775 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 721 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  30.91 
 
 		 812 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  32.94 
 
 		 723 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 763 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  31.15 
 
 		 567 aa  254  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  30.37 
 
 		 772 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 783 aa  253  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  30.21 
 
 		 847 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.25 
 
 		 844 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  30.21 
 
 		 847 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  30.52 
 
 		 625 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.05 
 
 		 847 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  32.92 
 
 		 732 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  32.86 
 
 		 732 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 709 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.32 
 
 		 846 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 762 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  30.17 
 
 		 852 aa  240  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  32.06 
 
 		 731 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  30.24 
 
 		 856 aa  235  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  30.69 
 
 		 936 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.51 
 
 		 884 aa  233  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  25.42 
 
 		 908 aa  233  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  31.13 
 
 		 980 aa  231  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  29.84 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  30.6 
 
 		 844 aa  226  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  30.93 
 
 		 931 aa  225  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 865 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 		 874 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 875 aa  218  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.24 
 
 		 895 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 		 508 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 740 aa  210  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 871 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 864 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  28.54 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  27.03 
 
 		 689 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  30.16 
 
 		 822 aa  195  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 798 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  38.76 
 
 		 931 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 594 aa  180  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>