248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1349 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  64.29 
 
 
309 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  46.56 
 
 
303 aa  308  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  47.99 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  46.44 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  43.33 
 
 
298 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  35 
 
 
310 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  34.87 
 
 
299 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  37.63 
 
 
303 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  35 
 
 
300 aa  170  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  33.68 
 
 
309 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  34.02 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  34.02 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  33.68 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  33.69 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  33.8 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 
295 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  29.62 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.46 
 
 
291 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  32.66 
 
 
308 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 
295 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.66 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.96 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  24.17 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.81 
 
 
293 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.07 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 
296 aa  89  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  23.94 
 
 
291 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 
303 aa  89  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  26.57 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  25.42 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  25.75 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.3 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.86 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.6 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.21 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  22.97 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.72 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.19 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.02 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  23.71 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.63 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  25.84 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.24 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  24.49 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.91 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.54 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  28.42 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  23.41 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25.1 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.97 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.94 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  25.35 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  22.37 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  24.33 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  27.18 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.71 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.19 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  22.74 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  22.3 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.42 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  25.18 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.34 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.3 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.74 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.64 
 
 
444 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.61 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  24.11 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.5 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  26.34 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  25.24 
 
 
447 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  24.26 
 
 
429 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  27.05 
 
 
443 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  23.74 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  29.25 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  24.63 
 
 
443 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.26 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  20.09 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.13 
 
 
440 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  23.18 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  24.87 
 
 
443 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  23.83 
 
 
444 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  24.76 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.43 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  20.65 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  24.35 
 
 
443 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  22.31 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  21.66 
 
 
353 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  24.02 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  21.3 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 
444 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  21.28 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  29.74 
 
 
444 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>