More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1210 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 460 aa  951    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  36.27 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  39.49 
 
 		 1048 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  36.91 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  34.79 
 
 		 459 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  36.67 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  35.59 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  33.74 
 
 		 450 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  32.1 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  31.04 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  27.91 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  27.91 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  30.2 
 
 		 510 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  29.08 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  29.08 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.11 
 
 		 511 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  28.81 
 
 		 728 aa  136  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  27.31 
 
 		 562 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  24.01 
 
 		 682 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  28.32 
 
 		 687 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  28.94 
 
 		 815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 635 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 582 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  23.38 
 
 		 549 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  26.44 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  27.19 
 
 		 678 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  26.77 
 
 		 667 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.35 
 
 		 575 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  24.72 
 
 		 674 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  25.92 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  26.89 
 
 		 657 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  26.63 
 
 		 684 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 651 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  22.4 
 
 		 1100 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 560 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 		 758 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  23 
 
 		 1088 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  26.76 
 
 		 657 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  24.81 
 
 		 663 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  26.04 
 
 		 651 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  23.75 
 
 		 610 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  26.55 
 
 		 659 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.18 
 
 		 484 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  25.69 
 
 		 675 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 684 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  24.93 
 
 		 646 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  25.72 
 
 		 688 aa  101  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.65 
 
 		 586 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 		 541 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.42 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 553 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  31.16 
 
 		 543 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  23.7 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 		 705 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  24.4 
 
 		 672 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  25.46 
 
 		 695 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  23.68 
 
 		 591 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  25.46 
 
 		 695 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  22.44 
 
 		 595 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  25.8 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  30.2 
 
 		 1100 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 1124 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  30.85 
 
 		 541 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  28.83 
 
 		 663 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.39 
 
 		 560 aa  99  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  29.91 
 
 		 690 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 838 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  25.46 
 
 		 695 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  23.23 
 
 		 1093 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  30.54 
 
 		 1099 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  29 
 
 		 541 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  26.56 
 
 		 674 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  23.6 
 
 		 551 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  29.7 
 
 		 1100 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  28.7 
 
 		 681 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 663 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.82 
 
 		 574 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  28.89 
 
 		 656 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  26.49 
 
 		 1102 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  23.9 
 
 		 1093 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  24.2 
 
 		 537 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  29.06 
 
 		 1101 aa  96.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  28.57 
 
 		 701 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  22.71 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  26.49 
 
 		 1102 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  29.19 
 
 		 606 aa  96.3  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  31.34 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  25.93 
 
 		 1115 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 		 752 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  26.49 
 
 		 1102 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  25.54 
 
 		 639 aa  95.5  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  29.46 
 
 		 715 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>