More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0520 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  93.48 
 
 
537 aa  915    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  100 
 
 
537 aa  1073    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  93.11 
 
 
537 aa  910    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  44.38 
 
 
705 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  50.29 
 
 
541 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 
593 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  36.86 
 
 
595 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  37.99 
 
 
541 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  40.46 
 
 
545 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  39.71 
 
 
541 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  34.6 
 
 
536 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  34.06 
 
 
549 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  34.58 
 
 
540 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  33.8 
 
 
536 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  34.57 
 
 
545 aa  249  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  34.4 
 
 
536 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  33.6 
 
 
536 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  39.79 
 
 
588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  34.33 
 
 
538 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  34.72 
 
 
515 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  33.53 
 
 
550 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  35.34 
 
 
541 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  32.03 
 
 
543 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  33.2 
 
 
564 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  36 
 
 
533 aa  238  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  32.4 
 
 
553 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  32.37 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  35.43 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 
532 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  35.87 
 
 
542 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  35.17 
 
 
538 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  32.25 
 
 
610 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  33.13 
 
 
535 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  32.97 
 
 
583 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  35.35 
 
 
540 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  32.32 
 
 
555 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  32.99 
 
 
568 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  31.92 
 
 
550 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  29.13 
 
 
554 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  31.65 
 
 
572 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  31.98 
 
 
550 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  35.38 
 
 
535 aa  226  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  28.29 
 
 
554 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  31.71 
 
 
550 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  32.19 
 
 
567 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  34.85 
 
 
540 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 
555 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  33.54 
 
 
529 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  36.66 
 
 
528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  31.73 
 
 
547 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  32.09 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  31.61 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  32.66 
 
 
578 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  29.19 
 
 
568 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  31.83 
 
 
548 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  27.72 
 
 
554 aa  220  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  32.94 
 
 
539 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  26.43 
 
 
554 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  27.92 
 
 
561 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  32.19 
 
 
575 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  32.65 
 
 
574 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  27.8 
 
 
551 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.65 
 
 
554 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  31.35 
 
 
577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  31.95 
 
 
551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  37.13 
 
 
448 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  31.32 
 
 
591 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  30.12 
 
 
530 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  31.93 
 
 
571 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  31.88 
 
 
596 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  31.88 
 
 
596 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  27.61 
 
 
554 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  31.88 
 
 
596 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  32.23 
 
 
577 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  27.76 
 
 
554 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 
558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  29.74 
 
 
600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  28.12 
 
 
549 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  28.12 
 
 
549 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  29.74 
 
 
553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  31.49 
 
 
601 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  29.77 
 
 
562 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  30.47 
 
 
556 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  31.42 
 
 
556 aa  213  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.24 
 
 
515 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  30.65 
 
 
598 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.33 
 
 
562 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  27.47 
 
 
554 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  30.43 
 
 
1139 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  31.9 
 
 
537 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 
554 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  32.05 
 
 
557 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  27.56 
 
 
554 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  27.56 
 
 
554 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  27.56 
 
 
554 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 
562 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  27.56 
 
 
554 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.38 
 
 
560 aa  211  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  31.19 
 
 
585 aa  210  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  26.77 
 
 
554 aa  210  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>