More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4138 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 541 aa  1095    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  44.49 
 
 		 705 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  52.02 
 
 		 537 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  51.62 
 
 		 537 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  50.29 
 
 		 537 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 593 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 588 aa  279  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  38.81 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  39.57 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  38.15 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  38.79 
 
 		 545 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  32.02 
 
 		 1115 aa  253  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  31.23 
 
 		 1102 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  33.27 
 
 		 577 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  33.21 
 
 		 1121 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  32.67 
 
 		 1088 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  33.27 
 
 		 1164 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  33.27 
 
 		 1164 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  31.41 
 
 		 1102 aa  246  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  36.02 
 
 		 583 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  31.41 
 
 		 1102 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1160 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  31.25 
 
 		 1101 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  33.14 
 
 		 596 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  33.14 
 
 		 596 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  32.01 
 
 		 1154 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  31.14 
 
 		 1154 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  33.14 
 
 		 596 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  31.99 
 
 		 1130 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  32.27 
 
 		 1088 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  32.41 
 
 		 1137 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  32.41 
 
 		 1137 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  32.41 
 
 		 1137 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  32.27 
 
 		 1088 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  32.27 
 
 		 1088 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  31.51 
 
 		 549 aa  243  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  31.97 
 
 		 610 aa  243  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  31.61 
 
 		 1152 aa  243  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  34.07 
 
 		 1108 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 		 1138 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  32.21 
 
 		 1137 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  31.77 
 
 		 1142 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  32.11 
 
 		 1136 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  32.13 
 
 		 1100 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  32.24 
 
 		 1098 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  32.89 
 
 		 606 aa  240  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  31.69 
 
 		 1100 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  31.63 
 
 		 1112 aa  240  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  31.01 
 
 		 1121 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  31.1 
 
 		 1104 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  31.63 
 
 		 1093 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  32.21 
 
 		 574 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  31.27 
 
 		 1092 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  31.61 
 
 		 1137 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  35.29 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  32 
 
 		 572 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  31.63 
 
 		 1105 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  31.2 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  32.01 
 
 		 1131 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  32.01 
 
 		 1131 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  32.02 
 
 		 1109 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  35.95 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  32.01 
 
 		 1131 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  32.01 
 
 		 1131 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  32.01 
 
 		 1131 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  32.01 
 
 		 1131 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  31.04 
 
 		 1106 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  31.74 
 
 		 682 aa  237  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  32.29 
 
 		 1100 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  31.04 
 
 		 1106 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  30.82 
 
 		 548 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  31.47 
 
 		 1088 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  31.24 
 
 		 1106 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  31.27 
 
 		 1101 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  35.18 
 
 		 558 aa  236  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  32.29 
 
 		 1100 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  31.13 
 
 		 1113 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  30.31 
 
 		 591 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  31.04 
 
 		 1093 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  33.66 
 
 		 1112 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  30.89 
 
 		 1100 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  32.14 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  31.47 
 
 		 1085 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  31.55 
 
 		 567 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  31.9 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  32.42 
 
 		 1121 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  32.59 
 
 		 587 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.5 
 
 		 1110 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  31.39 
 
 		 591 aa  233  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  32.17 
 
 		 1139 aa  233  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  31.53 
 
 		 585 aa  233  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  30.86 
 
 		 1108 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  30.88 
 
 		 1095 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  30.93 
 
 		 1110 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  30.77 
 
 		 1100 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  33.73 
 
 		 1111 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  35.74 
 
 		 528 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  31.47 
 
 		 1088 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  32.94 
 
 		 1108 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  30.58 
 
 		 1100 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>