More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0549 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  98.14 
 
 		 537 aa  1049    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  93.48 
 
 		 537 aa  935    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 537 aa  1067    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  45.45 
 
 		 705 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  52.09 
 
 		 541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  38.72 
 
 		 595 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 		 593 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  41.39 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  39.37 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  40.77 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  36.06 
 
 		 545 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  35.67 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  34.92 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  34.97 
 
 		 540 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  35.18 
 
 		 536 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  34.78 
 
 		 536 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  34.93 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  35 
 
 		 538 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  35.89 
 
 		 533 aa  246  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  34.03 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 		 541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  34.55 
 
 		 583 aa  243  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  33.66 
 
 		 550 aa  243  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  34.03 
 
 		 535 aa  243  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  32.74 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  34.56 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  36.25 
 
 		 538 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  33.13 
 
 		 553 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  36.64 
 
 		 540 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  32.88 
 
 		 610 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  37.07 
 
 		 542 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  35.94 
 
 		 541 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  32.24 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  33.45 
 
 		 567 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  34.32 
 
 		 525 aa  236  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  36.33 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  34.85 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  35.29 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  33.2 
 
 		 564 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  32.75 
 
 		 562 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  28.73 
 
 		 561 aa  230  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  32.73 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  32.93 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  33.54 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  28.65 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  36.5 
 
 		 528 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  32.06 
 
 		 577 aa  226  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  31.91 
 
 		 548 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  29.13 
 
 		 555 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  30.96 
 
 		 553 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  32.02 
 
 		 591 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  32.67 
 
 		 601 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  28.71 
 
 		 568 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  33.2 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  32.78 
 
 		 578 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  32.02 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  37.81 
 
 		 448 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  32.04 
 
 		 556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  32.28 
 
 		 547 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  32.13 
 
 		 550 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  31.4 
 
 		 598 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  32.8 
 
 		 596 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  32.8 
 
 		 596 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  31.58 
 
 		 572 aa  220  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  31.95 
 
 		 551 aa  220  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 575 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  32.8 
 
 		 596 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  31.06 
 
 		 1139 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  31.08 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  27.72 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  34.03 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  31.99 
 
 		 585 aa  219  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  30.57 
 
 		 583 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  32.26 
 
 		 572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  27.72 
 
 		 554 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  32.22 
 
 		 587 aa  217  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1110 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  30.92 
 
 		 562 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  31.78 
 
 		 555 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  31.27 
 
 		 567 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  31.25 
 
 		 591 aa  216  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  28.95 
 
 		 600 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  35.54 
 
 		 518 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  33.12 
 
 		 601 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  26.75 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  30.61 
 
 		 598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  27.33 
 
 		 551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  33.26 
 
 		 572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  36.38 
 
 		 530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  32.42 
 
 		 558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.35 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  33.26 
 
 		 572 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  34.17 
 
 		 544 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  33.26 
 
 		 553 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  30.87 
 
 		 554 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  33.04 
 
 		 553 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>