More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0360 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  46.79 
 
 
815 aa  715    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 
815 aa  1644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  33.95 
 
 
786 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  30 
 
 
800 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  26.74 
 
 
775 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  31.71 
 
 
795 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  27.44 
 
 
794 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  27.04 
 
 
798 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  25.44 
 
 
783 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  27.56 
 
 
772 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  25.7 
 
 
767 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  26.59 
 
 
796 aa  258  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.81 
 
 
802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  29.94 
 
 
784 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  25.1 
 
 
759 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  27.03 
 
 
822 aa  221  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  24.68 
 
 
753 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
804 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.31 
 
 
790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.35 
 
 
756 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.04 
 
 
755 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.59 
 
 
753 aa  157  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  24.37 
 
 
721 aa  154  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.48 
 
 
741 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.81 
 
 
745 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.83 
 
 
736 aa  152  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  25.13 
 
 
719 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  26.78 
 
 
716 aa  151  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.01 
 
 
464 aa  151  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.6 
 
 
741 aa  151  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  25.31 
 
 
719 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  25.31 
 
 
719 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  25.31 
 
 
719 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 
737 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 
731 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  29.72 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  27.17 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  29.72 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  29.13 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.73 
 
 
741 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  30.19 
 
 
719 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.73 
 
 
741 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.73 
 
 
741 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.73 
 
 
741 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  26.49 
 
 
734 aa  148  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  29.44 
 
 
720 aa  148  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  29.44 
 
 
720 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  27.22 
 
 
726 aa  147  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  20.43 
 
 
739 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  29.44 
 
 
720 aa  147  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  29.44 
 
 
720 aa  147  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.17 
 
 
720 aa  147  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  29.17 
 
 
720 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  27.84 
 
 
740 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
730 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.45 
 
 
741 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.25 
 
 
806 aa  146  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  20.3 
 
 
739 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  27.95 
 
 
753 aa  144  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.47 
 
 
732 aa  144  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.28 
 
 
726 aa  144  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 
743 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  28.53 
 
 
735 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  19.9 
 
 
739 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.2 
 
 
820 aa  142  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  20.18 
 
 
739 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.25 
 
 
779 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  25.8 
 
 
740 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.84 
 
 
730 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  23.54 
 
 
800 aa  140  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.42 
 
 
730 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.69 
 
 
756 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.58 
 
 
741 aa  138  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.69 
 
 
720 aa  138  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.25 
 
 
721 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  29.79 
 
 
466 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  27.01 
 
 
766 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.59 
 
 
797 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.84 
 
 
772 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  30.61 
 
 
477 aa  137  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.3 
 
 
726 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 
726 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.3 
 
 
726 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.3 
 
 
726 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  29.79 
 
 
508 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  26.25 
 
 
733 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.3 
 
 
726 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.3 
 
 
726 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.3 
 
 
726 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.3 
 
 
726 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.01 
 
 
575 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  30.52 
 
 
722 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.74 
 
 
727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  27.13 
 
 
730 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  25.73 
 
 
764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  26.93 
 
 
753 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  24.95 
 
 
767 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  33.92 
 
 
484 aa  134  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  26.99 
 
 
753 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>