More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3092 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  100 
 
 
472 aa  922    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  73.39 
 
 
467 aa  647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  41.63 
 
 
451 aa  349  6e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.95 
 
 
467 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
455 aa  225  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.06 
 
 
477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  31.87 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.84 
 
 
447 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
455 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
455 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
454 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.53 
 
 
447 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.93 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
460 aa  163  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.4 
 
 
454 aa  161  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.31 
 
 
451 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
454 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.22 
 
 
455 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.24 
 
 
460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
448 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.09 
 
 
452 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.02 
 
 
456 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  29.41 
 
 
464 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.9 
 
 
442 aa  150  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  28.32 
 
 
451 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.41 
 
 
466 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.21 
 
 
448 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
456 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
493 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.18 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  23.96 
 
 
455 aa  140  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.97 
 
 
496 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
449 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
456 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
473 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.08 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.58 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.35 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.22 
 
 
496 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  23.58 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.66 
 
 
478 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  22.89 
 
 
442 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
461 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
455 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
437 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
468 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.72 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.7 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
457 aa  120  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  23.35 
 
 
452 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.5 
 
 
461 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  22.86 
 
 
450 aa  119  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.82 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  25.39 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  25.85 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.91 
 
 
446 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  26.32 
 
 
448 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  28.2 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  25.45 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  25.45 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.55 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  27.34 
 
 
470 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  24.89 
 
 
450 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.05 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  25.11 
 
 
467 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.45 
 
 
464 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.33 
 
 
448 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  24.89 
 
 
465 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  22.78 
 
 
460 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  24.26 
 
 
451 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  24.26 
 
 
451 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25.46 
 
 
454 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
440 aa  107  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
470 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25 
 
 
454 aa  107  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  25.24 
 
 
455 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  25.24 
 
 
455 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  25.24 
 
 
455 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  24.71 
 
 
451 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>