More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2984 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  81.02 
 
 		 216 aa  364  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  57.87 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  58.1 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  57.42 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  51.64 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  51.64 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  51.64 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  51.64 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  52.48 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  51.17 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  51.17 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  55.5 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  47.47 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  45.54 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  45.05 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  46.48 
 
 		 216 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  47.8 
 
 		 217 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  45.77 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  51.5 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  45.97 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  51 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  51 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  51 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  51 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  44.78 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  44.78 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  44.78 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  51.69 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  51.69 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  51.69 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  44.28 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  44.28 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  44.28 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  44.28 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  44.28 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  44.28 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  44.28 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  44.66 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  44.81 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  40.28 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  47.15 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  43.4 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  43.4 
 
 		 253 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  43.4 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  42.86 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  43.9 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  44.88 
 
 		 276 aa  158  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  40.38 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  43.07 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  44.76 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  43.46 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  39.9 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  40.19 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  42.93 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  41.98 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  39.9 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  43.46 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  42.86 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  44.29 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  42.47 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  41.78 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  39.9 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  41.04 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  39.27 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  40.29 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  42.47 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  41.98 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  40.57 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  41.55 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  41.51 
 
 		 253 aa  148  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  40.57 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  37.74 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  39.9 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  43.59 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  40.4 
 
 		 289 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  39.61 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  40.98 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  42 
 
 		 299 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  40.59 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  41.75 
 
 		 261 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  40 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  41.71 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  41.75 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  39.91 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  40.78 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  38.94 
 
 		 287 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  41.97 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 		 253 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  41.54 
 
 		 255 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0703  type III secretion system protein  45.08 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00859025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  43.35 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  41 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  40.1 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>