More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2735 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  301  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  43.86 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  26.81 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  26.09 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  28.03 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  25.36 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  30.08 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  44.29 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  26.81 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  29.7 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 174 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.32 
 
 		 191 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.9 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  28.15 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  31.13 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>