More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1134 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  93.27 
 
 		 401 aa  766    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  94.26 
 
 		 401 aa  778    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  100 
 
 		 401 aa  811    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.5 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33.67 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 405 aa  246  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  34 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  30.02 
 
 		 406 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 405 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  33.41 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.92 
 
 		 405 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  32.92 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  32.36 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  34.65 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  32.34 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 405 aa  226  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  30.75 
 
 		 401 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 407 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  30.65 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.26 
 
 		 463 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 406 aa  223  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  33.93 
 
 		 401 aa  222  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  33.75 
 
 		 419 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 463 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  32.21 
 
 		 406 aa  221  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  32.24 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.95 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  31.25 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  33.67 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  33 
 
 		 405 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.14 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 420 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  31.81 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  30.38 
 
 		 421 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  30.32 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 419 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  33.24 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  30.52 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  30.58 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  32.27 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  33.04 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 401 aa  213  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 421 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.46 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  35 
 
 		 407 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  31.11 
 
 		 407 aa  209  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  31.45 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.8 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  29.6 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  33.04 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  31.17 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  31.09 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  33.17 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  30.61 
 
 		 407 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  32.94 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  31.23 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  27.79 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 423 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  29.9 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  27.07 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  31.92 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  31.67 
 
 		 406 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>