200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1148 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  328  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.73 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.76 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  36.25 
 
 		 283 aa  50.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  36.05 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  36.47 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  29.9 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  37.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.81 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  32.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  35.8 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  40.62 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  40.28 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  29.63 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  29.63 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 322 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>