269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2887 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 396 aa  808    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  57.38 
 
 		 387 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.33 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  53.24 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.17 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  49.13 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.44 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.73 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.14 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.39 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.36 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.74 
 
 		 427 aa  256  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.43 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  40.58 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.61 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  42.54 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.55 
 
 		 460 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  42.6 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.32 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.15 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  35.22 
 
 		 471 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.23 
 
 		 570 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  38.71 
 
 		 676 aa  199  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  40.43 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  34.81 
 
 		 469 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  34.6 
 
 		 2172 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  38.46 
 
 		 488 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  36.72 
 
 		 475 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  34.91 
 
 		 766 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  35.17 
 
 		 875 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  40.36 
 
 		 748 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  29.95 
 
 		 712 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  34.11 
 
 		 585 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  30.69 
 
 		 518 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.48 
 
 		 841 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.43 
 
 		 1657 aa  145  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  33.04 
 
 		 342 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  32.21 
 
 		 999 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  32.21 
 
 		 999 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  32.21 
 
 		 999 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.23 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.64 
 
 		 1029 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  31.41 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  28.81 
 
 		 972 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  26.54 
 
 		 918 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  27.79 
 
 		 1138 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  25.89 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  26.54 
 
 		 1132 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  29.26 
 
 		 918 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.15 
 
 		 729 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  29.77 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  27.63 
 
 		 908 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.08 
 
 		 809 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  32.23 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.43 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  28.19 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.56 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  36.24 
 
 		 263 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 892 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  26.27 
 
 		 984 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  29.17 
 
 		 1182 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  33.58 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  29.84 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  30.18 
 
 		 1142 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  32.07 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.18 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.27 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  27.85 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  28.76 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  29.57 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  27.25 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  26.61 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  35.27 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.16 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  30.04 
 
 		 1151 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  28.86 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  29.45 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.02 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  28 
 
 		 941 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  27.44 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  37.04 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 374 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 374 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  30.66 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  37.02 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  25.57 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  27.08 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 		 381 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 		 1200 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.58 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  27.07 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  26.1 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>