More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1516 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 690 aa  1439    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 716 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.78 
 
 		 675 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 685 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 668 aa  239  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 675 aa  234  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 708 aa  230  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 654 aa  226  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 657 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 663 aa  223  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 674 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 697 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  28.01 
 
 		 682 aa  219  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 731 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 731 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 656 aa  207  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 683 aa  200  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 727 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 718 aa  187  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 744 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 693 aa  147  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.15 
 
 		 653 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 651 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 665 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  21.63 
 
 		 678 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 683 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 707 aa  71.6  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  21.15 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.72 
 
 		 666 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30.41 
 
 		 689 aa  70.1  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.34 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.72 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  26.39 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.34 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 662 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  25.93 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.93 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.93 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  25.93 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 688 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 662 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  20.62 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  25.78 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  23.56 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 697 aa  61.2  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 748 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 648 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.46 
 
 		 653 aa  60.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 642 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02495  hypothetical protein  25.34 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  26.67 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  20.08 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1684  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 623 aa  57.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  22.78 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  20.23 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  20.23 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 661 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 698 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 656 aa  56.2  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 743 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.97 
 
 		 623 aa  56.6  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 671 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  21.47 
 
 		 667 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.33 
 
 		 656 aa  56.6  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>