More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0029 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
346 aa  691    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  88.08 
 
 
345 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  80.06 
 
 
344 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  78.61 
 
 
344 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  68.34 
 
 
348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  64.94 
 
 
348 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  66.18 
 
 
347 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  64.69 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  60.3 
 
 
341 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  58.04 
 
 
343 aa  359  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.42 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  52.28 
 
 
405 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.75 
 
 
342 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.44 
 
 
341 aa  119  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.72 
 
 
327 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  42.52 
 
 
364 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  32.32 
 
 
341 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 
329 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  42.14 
 
 
362 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.05 
 
 
354 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  35.39 
 
 
355 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  29.78 
 
 
361 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 
344 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 
341 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  29.46 
 
 
345 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  31.23 
 
 
345 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  31.01 
 
 
361 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 
341 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  32.72 
 
 
340 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  37.09 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 
363 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  40.91 
 
 
334 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  29.91 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  40.91 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  29.97 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  28.61 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  34.53 
 
 
381 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  30.91 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  35.81 
 
 
342 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.95 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  28.96 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  35.86 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.46 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  38.36 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  35.43 
 
 
380 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  32.08 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  28.29 
 
 
346 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  37.09 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  27.55 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  32.95 
 
 
364 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.27 
 
 
6889 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  36.36 
 
 
355 aa  92.4  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  45 
 
 
352 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  30.28 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  28.57 
 
 
346 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  29.02 
 
 
338 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  28 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  36.92 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  29.34 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  29.34 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.98 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 
367 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  42.61 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  29.75 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  28.29 
 
 
347 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  55 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.29 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  29.48 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.54 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.86 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 
362 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  36.67 
 
 
362 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  37.93 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  41.18 
 
 
362 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.44 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  30.15 
 
 
340 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  29.57 
 
 
340 aa  86.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  42.86 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  41.67 
 
 
307 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.7 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  28.92 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  37.58 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  26.94 
 
 
386 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  28.96 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.96 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  33.1 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  29.69 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>