More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1218 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  100 
 
 		 358 aa  730    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  39.47 
 
 		 483 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  41.09 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  35.58 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  32.24 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  33.55 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  33.65 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  33.43 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  34.83 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  33.65 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  33.12 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.16 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.37 
 
 		 375 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.77 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.39 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 682 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30.8 
 
 		 315 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  29.05 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.08 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 682 aa  99  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  31.72 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  31.84 
 
 		 267 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 299 aa  96.3  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.22 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  31.05 
 
 		 299 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.92 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.53 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.18 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.18 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  28.15 
 
 		 517 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  29.8 
 
 		 288 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.94 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 364 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.92 
 
 		 375 aa  89.4  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  31.27 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 291 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 296 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 276 aa  86.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.72 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.53 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  30.5 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  26.95 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.16 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.18 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  24.93 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  26.59 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  24.55 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>