More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3198 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  67.56 
 
 		 245 aa  328  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.02 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.39 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.08 
 
 		 227 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  50.22 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.22 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.22 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  50.22 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.13 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.13 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  51.13 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.68 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.68 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  45 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.85 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  39.73 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.22 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.22 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.95 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.05 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.44 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.44 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.11 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.11 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  33.64 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  33.18 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  33.65 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  32.27 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3331  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  29.09 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2638  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.38 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3081  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0390484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  31.53 
 
 		 495 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.11 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  26.73 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  32.78 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.8 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  25.81 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.45 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.72 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  25 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  30.41 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  29.29 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  29.38 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  25.51 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.58 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  26.44 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>