274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4785 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  78.78 
 
 		 514 aa  775    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  100 
 
 		 527 aa  1063    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  82.55 
 
 		 510 aa  825    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  70.53 
 
 		 528 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  81.44 
 
 		 521 aa  831    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  81.94 
 
 		 521 aa  824    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  60.28 
 
 		 499 aa  594  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  54.29 
 
 		 503 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  52.31 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  53.29 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  52.6 
 
 		 508 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  53.52 
 
 		 525 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  54.87 
 
 		 510 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  53.52 
 
 		 525 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  53.52 
 
 		 525 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  51.3 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  51.1 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  51.1 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  51.1 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  50.9 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  50.7 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  41.2 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  41.13 
 
 		 536 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  42.54 
 
 		 567 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  44.08 
 
 		 538 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  41.75 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  41.25 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  40.04 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  40.85 
 
 		 529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  43.11 
 
 		 521 aa  326  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  42.52 
 
 		 519 aa  313  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  39.61 
 
 		 520 aa  301  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  38.98 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  39.59 
 
 		 520 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  39.59 
 
 		 520 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  37.7 
 
 		 522 aa  266  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  36.9 
 
 		 523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  30.29 
 
 		 570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  31.32 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  29.66 
 
 		 577 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  29.52 
 
 		 568 aa  203  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  30 
 
 		 577 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  29.54 
 
 		 577 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  30.65 
 
 		 571 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  30.68 
 
 		 575 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  29.67 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  30.4 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  30.4 
 
 		 574 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  30.41 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  30.41 
 
 		 574 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  29.58 
 
 		 586 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  29.69 
 
 		 576 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  30.18 
 
 		 575 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  29.25 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  31.29 
 
 		 574 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  43.12 
 
 		 375 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  43.72 
 
 		 363 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  43.58 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  44.19 
 
 		 360 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  44.19 
 
 		 360 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  44.19 
 
 		 360 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  44.19 
 
 		 369 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  44.19 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  32.68 
 
 		 304 aa  144  5e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  30.55 
 
 		 303 aa  141  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  35.62 
 
 		 326 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  29.53 
 
 		 310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  36.51 
 
 		 287 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  32.44 
 
 		 308 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  32.44 
 
 		 308 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  34.22 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  37.21 
 
 		 277 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  35.78 
 
 		 280 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  32.42 
 
 		 283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  29.24 
 
 		 308 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  28.3 
 
 		 285 aa  130  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  36.21 
 
 		 280 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  35.78 
 
 		 280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  33.2 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  34.29 
 
 		 291 aa  128  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  31.22 
 
 		 283 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  34.53 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  34.76 
 
 		 286 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  34.55 
 
 		 279 aa  124  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  35.5 
 
 		 375 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  30.29 
 
 		 301 aa  123  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  33.96 
 
 		 276 aa  123  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  31.19 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  34.39 
 
 		 285 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  34.39 
 
 		 279 aa  120  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  30.04 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  33.33 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  31.48 
 
 		 275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  34.39 
 
 		 295 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  34.39 
 
 		 285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  34.7 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  33.03 
 
 		 328 aa  117  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  32.74 
 
 		 289 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  31.42 
 
 		 275 aa  116  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  33.48 
 
 		 285 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>