155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5365 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  100 
 
 		 1088 aa  2222    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  43.66 
 
 		 802 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  38.04 
 
 		 569 aa  347  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.41 
 
 		 580 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  28.62 
 
 		 354 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.64 
 
 		 508 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5172  hypothetical protein  27.49 
 
 		 826 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  31.71 
 
 		 528 aa  92.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.2 
 
 		 1107 aa  91.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.29 
 
 		 863 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.07 
 
 		 1263 aa  91.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 1041 aa  89  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  30.47 
 
 		 559 aa  89.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  53.73 
 
 		 1422 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  32.09 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  56.25 
 
 		 1329 aa  76.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  25.09 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.69 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.56 
 
 		 892 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  25.41 
 
 		 867 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.63 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  44.62 
 
 		 1838 aa  72.4  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4404  hypothetical protein  34.82 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.51 
 
 		 476 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.53 
 
 		 1015 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.02 
 
 		 1749 aa  69.7  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  41.54 
 
 		 1297 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.99 
 
 		 1024 aa  68.2  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  21.9 
 
 		 1440 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.04 
 
 		 242 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  45.31 
 
 		 1291 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  26.36 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  28.36 
 
 		 204 aa  66.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.15 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  24.35 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  27.62 
 
 		 416 aa  64.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.45 
 
 		 472 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.07 
 
 		 1344 aa  63.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  27.47 
 
 		 937 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  29.08 
 
 		 656 aa  63.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1822 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.97 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  27.2 
 
 		 937 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0685  hypothetical protein  30.23 
 
 		 443 aa  61.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  25.56 
 
 		 296 aa  60.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  30.4 
 
 		 761 aa  60.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  24.88 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  27.98 
 
 		 925 aa  58.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  26 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  28.57 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 437 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6139  hypothetical protein  26.35 
 
 		 339 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 437 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 437 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  39.06 
 
 		 1314 aa  56.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  33.61 
 
 		 509 aa  56.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 		 414 aa  55.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.71 
 
 		 886 aa  55.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 444 aa  55.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  37.08 
 
 		 647 aa  55.1  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  40.3 
 
 		 244 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 445 aa  54.3  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 445 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2934  hypothetical protein  30.13 
 
 		 613 aa  54.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  28 
 
 		 396 aa  53.9  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  40.3 
 
 		 244 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 473 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  40.3 
 
 		 244 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 412 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  28.57 
 
 		 293 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  40.3 
 
 		 244 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  35.21 
 
 		 1264 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.5 
 
 		 305 aa  53.5  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1744 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2640  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.766931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 471 aa  53.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 441 aa  52.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  32.26 
 
 		 291 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  44.07 
 
 		 1030 aa  52.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 440 aa  51.6  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1368  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  52  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000107124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  38.03 
 
 		 1262 aa  51.6  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  28.57 
 
 		 446 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.9 
 
 		 434 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  39.39 
 
 		 194 aa  51.6  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  25.95 
 
 		 791 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  38.03 
 
 		 1264 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  27.38 
 
 		 447 aa  51.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  34.92 
 
 		 1822 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  26.63 
 
 		 413 aa  51.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  38.03 
 
 		 1264 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  38.03 
 
 		 1264 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  34.34 
 
 		 980 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.32 
 
 		 1266 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 		 469 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 437 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32072  predicted protein  36.45 
 
 		 381 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186816  normal  0.540489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 432 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>