53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4350 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  100 
 
 		 1440 aa  2986    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3559  hypothetical protein  38.86 
 
 		 647 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0381458  normal  0.0286784 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  62.32 
 
 		 244 aa  86.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  62.32 
 
 		 244 aa  86.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  60.87 
 
 		 244 aa  84  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  60.87 
 
 		 244 aa  84  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  35.88 
 
 		 1264 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  56.92 
 
 		 1030 aa  79.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  56.76 
 
 		 194 aa  79.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  61.29 
 
 		 1262 aa  75.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  51.76 
 
 		 1264 aa  74.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  47.19 
 
 		 263 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  51.76 
 
 		 1264 aa  74.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  51.76 
 
 		 1264 aa  74.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  47.19 
 
 		 263 aa  73.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  47.62 
 
 		 1422 aa  72.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  52.86 
 
 		 251 aa  72  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  51.56 
 
 		 146 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  53.03 
 
 		 263 aa  69.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 3172 aa  68.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  21.9 
 
 		 1088 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 3301 aa  68.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  48.39 
 
 		 1314 aa  67.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1822 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  41.56 
 
 		 1329 aa  62.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  46.88 
 
 		 1822 aa  62.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  41.54 
 
 		 1838 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  42.86 
 
 		 1297 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  41.94 
 
 		 1291 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  32.84 
 
 		 475 aa  53.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.19 
 
 		 725 aa  52.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 3145 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 758 aa  52.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.82 
 
 		 681 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 739 aa  50.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.81 
 
 		 573 aa  49.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  48.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 		 632 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 217 aa  48.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.38 
 
 		 676 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  37.7 
 
 		 182 aa  47.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 367 aa  47.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28 
 
 		 810 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 878 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.49 
 
 		 745 aa  47  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 828 aa  46.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  24.55 
 
 		 560 aa  46.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 828 aa  46.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  26.34 
 
 		 734 aa  45.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 436 aa  45.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 762 aa  45.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 824 aa  45.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>