25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2071 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 475 aa  972    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7598  hypothetical protein  67.43 
 
 		 480 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  60.21 
 
 		 475 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  46.58 
 
 		 615 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  39.29 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  36.78 
 
 		 1329 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  43.1 
 
 		 1838 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 687 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  32.84 
 
 		 1440 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  46.88 
 
 		 1422 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  33.78 
 
 		 1030 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  39.39 
 
 		 1822 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3730  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1822 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  35.59 
 
 		 1291 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  28.45 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  40.35 
 
 		 1314 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.5 
 
 		 352 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  40.35 
 
 		 1297 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  32.39 
 
 		 146 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  28.74 
 
 		 194 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  29.51 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  35.19 
 
 		 1264 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.05 
 
 		 774 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>