22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4135 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  100 
 
 		 475 aa  958    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  60.21 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7598  hypothetical protein  62.37 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  42.22 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  39.08 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  44.68 
 
 		 1422 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  40 
 
 		 1291 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  40.74 
 
 		 1440 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  39.71 
 
 		 1822 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  40.68 
 
 		 1030 aa  50.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  34.25 
 
 		 1329 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  38.18 
 
 		 146 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  41.82 
 
 		 1262 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  42.11 
 
 		 1314 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.34 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  38.18 
 
 		 1264 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  41.94 
 
 		 1297 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  38.89 
 
 		 194 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  32.88 
 
 		 1088 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  34.43 
 
 		 1838 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  39.39 
 
 		 1822 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 		 324 aa  43.1  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>