83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3021 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  100 
 
 		 1314 aa  2552    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  40.61 
 
 		 1216 aa  622  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  40.71 
 
 		 1099 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  41.94 
 
 		 1127 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  41.27 
 
 		 1116 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  40.32 
 
 		 1104 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  40.49 
 
 		 1130 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  37.98 
 
 		 1083 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  39.21 
 
 		 1086 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1055 aa  509  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1012 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  40.32 
 
 		 1262 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  39.01 
 
 		 1264 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  44.69 
 
 		 1422 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  38.51 
 
 		 1264 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  38.84 
 
 		 1264 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  38.78 
 
 		 1264 aa  392  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  36.1 
 
 		 1125 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  35.68 
 
 		 988 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  43.34 
 
 		 1178 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  39.24 
 
 		 963 aa  363  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.73 
 
 		 1329 aa  357  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1001 aa  340  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  33.58 
 
 		 1086 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  44.52 
 
 		 1297 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1210 aa  281  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1210 aa  281  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  36.91 
 
 		 1220 aa  272  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  36.24 
 
 		 1210 aa  272  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  36.69 
 
 		 1210 aa  270  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  36.47 
 
 		 1210 aa  267  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  37.5 
 
 		 1291 aa  266  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  36.02 
 
 		 1209 aa  263  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  30.78 
 
 		 971 aa  199  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  29.57 
 
 		 1137 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1139 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.64 
 
 		 1146 aa  149  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.86 
 
 		 1139 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  28.25 
 
 		 1139 aa  149  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1139 aa  147  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1275 aa  145  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1108 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1249 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  26.29 
 
 		 465 aa  95.9  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.65 
 
 		 903 aa  95.1  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  21.98 
 
 		 1094 aa  84.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  24.18 
 
 		 634 aa  82.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  20 
 
 		 898 aa  72.4  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  22.13 
 
 		 857 aa  69.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  48.39 
 
 		 1440 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  23.67 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  27.6 
 
 		 811 aa  66.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.28 
 
 		 852 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  45.31 
 
 		 1030 aa  62.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.09 
 
 		 817 aa  62.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  22.57 
 
 		 762 aa  61.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  47.54 
 
 		 1838 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  19.54 
 
 		 800 aa  61.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  47.62 
 
 		 146 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  25.21 
 
 		 670 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  44.64 
 
 		 182 aa  57  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  39.06 
 
 		 1088 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  18.23 
 
 		 774 aa  55.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  30.61 
 
 		 725 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  21.63 
 
 		 837 aa  53.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  40.3 
 
 		 263 aa  53.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  38.46 
 
 		 251 aa  52.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  32.23 
 
 		 194 aa  53.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  40.3 
 
 		 263 aa  53.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  44.78 
 
 		 1822 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  22.41 
 
 		 739 aa  52  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  38.46 
 
 		 244 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  41.54 
 
 		 1822 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  38.46 
 
 		 244 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 802 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  42.37 
 
 		 244 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  42.37 
 
 		 244 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  42.86 
 
 		 263 aa  48.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  40.35 
 
 		 475 aa  47.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  20.98 
 
 		 862 aa  46.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  37.96 
 
 		 1556 aa  45.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  37.5 
 
 		 184 aa  45.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>