28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4733 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  100 
 
 
1030 aa  2104    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  56.92 
 
 
1440 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  50 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  50.75 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  50.75 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  40.3 
 
 
1822 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.74 
 
 
1329 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  45.31 
 
 
1314 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  40 
 
 
1422 aa  62  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  33.33 
 
 
263 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  38.46 
 
 
1838 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  50 
 
 
263 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  48.21 
 
 
263 aa  58.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  33.33 
 
 
1262 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  43.94 
 
 
146 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  39.47 
 
 
194 aa  55.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  44.07 
 
 
1264 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 
1264 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  33.33 
 
 
1264 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  33.33 
 
 
1264 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  44.44 
 
 
1822 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  33.78 
 
 
475 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  36.21 
 
 
1297 aa  52  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  44.07 
 
 
1088 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  36.07 
 
 
1291 aa  46.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  40.91 
 
 
1216 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>