28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1241 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  100 
 
 		 244 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 244 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  96.72 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  96.72 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  38.65 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1957  WGR domain-containing protein  36.53 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  62.32 
 
 		 1440 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  50.72 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  50.75 
 
 		 1030 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  50.72 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  45.71 
 
 		 1264 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  45.83 
 
 		 1262 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  50.72 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  47.14 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  47.14 
 
 		 1264 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  47.14 
 
 		 1264 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  47.14 
 
 		 1264 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  43.08 
 
 		 1822 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  46.88 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  38.1 
 
 		 1329 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  42.11 
 
 		 1838 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  40.3 
 
 		 1088 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1422 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  41.27 
 
 		 1822 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  38.46 
 
 		 1314 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0896  hypothetical protein  45.65 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0155948  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  32.81 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  40.43 
 
 		 252 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>