33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1569 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  50.77 
 
 		 1440 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  46.38 
 
 		 1838 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  40.74 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  44.78 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  44.78 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  47.62 
 
 		 1422 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  47.54 
 
 		 244 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  47.54 
 
 		 244 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  44.62 
 
 		 1262 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  47.62 
 
 		 1314 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  42.25 
 
 		 1329 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  43.94 
 
 		 1030 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  43.08 
 
 		 1264 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  43.08 
 
 		 1264 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  43.08 
 
 		 1264 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  43.55 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  38.46 
 
 		 1264 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  38.03 
 
 		 263 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  38.03 
 
 		 263 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1822 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  36.62 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  38.75 
 
 		 1291 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  33.9 
 
 		 1088 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  32.94 
 
 		 475 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  35.38 
 
 		 1822 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  43.48 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  37.88 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  42.31 
 
 		 1297 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  38.1 
 
 		 1216 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  43.28 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  39.13 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>