43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4993 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  100 
 
 
111 aa  226  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  59.05 
 
 
109 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  73.17 
 
 
85 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  70.73 
 
 
85 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  77.03 
 
 
85 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  60.42 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  55.13 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  55.13 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  56.16 
 
 
86 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  52 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  46.08 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  48.65 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  44.16 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  43.84 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  55.93 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  48.57 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  46.58 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  49.12 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  49.12 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  49.12 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  42.45 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  46.58 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  40.54 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  40.54 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  47.5 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  44.44 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  41.67 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  39.19 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  40.85 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  40.58 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  38.89 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  47.14 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  53.33 
 
 
1822 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  38.89 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  38.03 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  43.48 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  32.86 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02180  hypothetical protein  34.78 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  40 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  41.3 
 
 
1838 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  33.82 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  41.3 
 
 
1314 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>