68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1394 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  100 
 
 
1297 aa  2484    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  45.93 
 
 
1291 aa  693    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  48.07 
 
 
1329 aa  1124    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  40.38 
 
 
1422 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  41.44 
 
 
1264 aa  493  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  41.27 
 
 
1264 aa  492  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  41.06 
 
 
1264 aa  486  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  40.94 
 
 
1264 aa  482  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  46.64 
 
 
1262 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  39.88 
 
 
1216 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  42.86 
 
 
1127 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  42.47 
 
 
963 aa  432  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  40.86 
 
 
1083 aa  413  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  43.76 
 
 
1314 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  41.8 
 
 
1104 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  40.35 
 
 
1130 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  41.38 
 
 
1116 aa  364  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  40.54 
 
 
1099 aa  343  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  43.28 
 
 
1012 aa  338  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  34.94 
 
 
1210 aa  337  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  34.94 
 
 
1210 aa  337  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  33.67 
 
 
1220 aa  331  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  34.88 
 
 
1210 aa  330  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  35.52 
 
 
1209 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  34.79 
 
 
1210 aa  326  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  34.79 
 
 
1210 aa  326  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  43.65 
 
 
1055 aa  323  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  40.32 
 
 
1086 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  37.81 
 
 
1125 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  37.61 
 
 
1001 aa  287  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.38 
 
 
1086 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  39.11 
 
 
1178 aa  261  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  37.14 
 
 
988 aa  229  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  28.67 
 
 
1139 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  26.79 
 
 
1137 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  30.13 
 
 
1139 aa  160  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  29.8 
 
 
1139 aa  159  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  29.92 
 
 
1139 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  24.94 
 
 
1108 aa  134  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.68 
 
 
1275 aa  128  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  30.97 
 
 
971 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.31 
 
 
1146 aa  114  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.07 
 
 
1249 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  26.76 
 
 
465 aa  93.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  26.33 
 
 
837 aa  78.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  22.22 
 
 
1094 aa  72.8  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  21.78 
 
 
754 aa  72.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  21.86 
 
 
789 aa  71.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  37.66 
 
 
1088 aa  70.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  26.05 
 
 
634 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  21.29 
 
 
898 aa  68.6  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.4 
 
 
857 aa  68.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  21.43 
 
 
800 aa  65.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  20.52 
 
 
774 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  15.71 
 
 
903 aa  62  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.44 
 
 
852 aa  61.6  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  40.62 
 
 
1822 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  47.69 
 
 
1838 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  42.86 
 
 
1440 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  46.67 
 
 
1822 aa  59.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.96 
 
 
811 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  21.25 
 
 
739 aa  58.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  29.49 
 
 
1030 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  24.48 
 
 
817 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  32.97 
 
 
475 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  38.64 
 
 
194 aa  45.8  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  38.46 
 
 
263 aa  45.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  37.23 
 
 
475 aa  45.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>