84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7546 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  52.76 
 
 		 1297 aa  928    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  100 
 
 		 1329 aa  2687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  39.17 
 
 		 1291 aa  602  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1422 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  43.78 
 
 		 1264 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  44.25 
 
 		 1264 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  44.09 
 
 		 1264 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  43.78 
 
 		 1264 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  43.63 
 
 		 1262 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  42.65 
 
 		 963 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  42.31 
 
 		 1216 aa  416  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  39.37 
 
 		 1127 aa  393  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1104 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  39.16 
 
 		 1130 aa  373  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  39.42 
 
 		 1083 aa  360  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  40.73 
 
 		 1314 aa  357  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  37.16 
 
 		 1099 aa  336  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  40.34 
 
 		 1116 aa  330  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1210 aa  326  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1210 aa  326  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  37.12 
 
 		 1012 aa  324  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.79 
 
 		 1220 aa  321  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  35.45 
 
 		 1210 aa  319  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  35.79 
 
 		 1209 aa  317  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  35.27 
 
 		 1210 aa  313  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.27 
 
 		 1210 aa  312  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  38.4 
 
 		 1055 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  31.65 
 
 		 1086 aa  292  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  35.4 
 
 		 1125 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  32.91 
 
 		 1086 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1001 aa  276  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1178 aa  236  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  33.6 
 
 		 988 aa  214  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  31.25 
 
 		 1137 aa  155  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  30.7 
 
 		 1139 aa  151  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  30.09 
 
 		 1139 aa  148  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29 
 
 		 1139 aa  147  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1139 aa  147  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1108 aa  142  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1275 aa  123  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  28.27 
 
 		 971 aa  120  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  23.53 
 
 		 1146 aa  115  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1249 aa  102  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  27.8 
 
 		 465 aa  87  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  22.8 
 
 		 1094 aa  87  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  56.25 
 
 		 1088 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  22.22 
 
 		 800 aa  73.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  22.34 
 
 		 857 aa  72  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  24.84 
 
 		 837 aa  68.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  53.12 
 
 		 1838 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.66 
 
 		 852 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  23.21 
 
 		 754 aa  65.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  23.87 
 
 		 898 aa  65.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  40.74 
 
 		 1030 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  22.35 
 
 		 789 aa  64.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  42.03 
 
 		 1822 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  41.56 
 
 		 1440 aa  62.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21.54 
 
 		 762 aa  61.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  48.28 
 
 		 1822 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  24.79 
 
 		 862 aa  59.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.03 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.26 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  21.78 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.88 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  36.78 
 
 		 475 aa  57.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  42.59 
 
 		 244 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  38.1 
 
 		 244 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  42.59 
 
 		 244 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  38.1 
 
 		 244 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  22.49 
 
 		 739 aa  55.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  42.25 
 
 		 146 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  41.18 
 
 		 263 aa  54.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  21.05 
 
 		 774 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  41.18 
 
 		 263 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  40.85 
 
 		 252 aa  52.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  25.25 
 
 		 817 aa  52.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  44.44 
 
 		 263 aa  51.6  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  25.42 
 
 		 194 aa  51.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  35.82 
 
 		 251 aa  49.3  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  28 
 
 		 862 aa  49.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  44.07 
 
 		 182 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  34.25 
 
 		 475 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7598  hypothetical protein  35 
 
 		 480 aa  46.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3730  WGR domain-containing protein  32.14 
 
 		 113 aa  45.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>