22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3449 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5198  hypothetical protein  37.82 
 
 		 168 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5570  hypothetical protein  42.24 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  39.29 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  39.08 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0841  hypothetical protein  29.91 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.468496  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  39.47 
 
 		 1329 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0958  hypothetical protein  31.82 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.169341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03058  hypothetical protein  28.67 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  41.79 
 
 		 1291 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  50 
 
 		 1440 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  32.47 
 
 		 86 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  29.9 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  36.36 
 
 		 1088 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  29.9 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1822 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7598  hypothetical protein  41.33 
 
 		 480 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350356  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  40.82 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  40.82 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  40.43 
 
 		 244 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  40.43 
 
 		 244 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1422 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>